本课程在原国家级精品课程、国家级精品资源共享课《生物信息学》基础上转型升级，是一门生命科学领域和信息科学领域的应用型交叉学科。本课程2022年被湖北省教育厅遴选为“线上一流课程”。课程共分为八章，分别是生物信息学概要、生物信息学数据库、生物信息学数据库检索、系统演化分析、基因分析和基因组注释、蛋白质分析、基因组浏览器、生物信息学其他应用。通过本课程的学习，可以培养学员具有生物信息学方面的理论基础和基本技能，能够运用所掌握的生物信息学理论、方法和技术初步解决科研和实际工作中生物信息的存储、检索、分析和利用的问题。本课程不仅有理论讲授，更有大量操作视频，并辅以在线互动答疑和其他相关资料。本课程由5名教授担纲教学，多名助教辅助教学。
第一章 生物信息学概要
1.1 生物信息学发展
1.2 生物信息学基本方法和技术
1.3 生物信息学研究内容
1.4 生物信息学应用
第一章 单元作业
第一章 单元测试
第二章 生物信息学数据库
2.1 核苷酸数据库
2.2 蛋白质数据库
2.3 其他数据库及数据提交
第二章 单元作业
第二章 单元测试
第三章 生物信息学数据库检索
3.1 关键词为基础的数据库检索
3.2 序列对位排列分析原理
3.3 序列为基础的数据库检索
第三章 单元作业
第三章 单元测试
第四章 系统演化分析
4.1 多序列对位排列
4.2 系统演化分析
4.3 MEGA应用
第四章 单元作业
第四章 单元测试
第五章 基因分析和基因组注释
5.5 ENCODE
5.1 编码蛋白质基因预测
5.2 非编码RNA基因预测
5.3 基因结构分析
5.4 miRNA及靶基因预测
第五章 单元作业
第五章 单元测试
第六章 蛋白质分析
6.1 蛋白质性质和结构分析
6.2 膜蛋白分析
6.3 蛋白质翻译后修饰分析
6.4 蛋白质亚细胞定位分析
第六章 单元作业
第六章 单元测试
第七章 基因组浏览器
7.1 UCSC基因组浏览器
7.2 Ensembl基因组浏览器
7.3 代表性模式生物数据库
7.4 代表性农作物数据库
第七章 单元测试
第七章 单元作业
第八章 生物信息学其他应用
8.1 芯片表达谱及RNA-seq应用
8.2 ChIP-seq技术及应用
8.3 Galaxy应用
8.4 GEO数据库应用
8.5 CRISPR gRNA设计
8.6 Primer设计
8.7 限制性核酸内切酶切割位点分析
8.8 测序在组学中的应用
第八章 单元测试
第八章 单元作业